Cómo sabemos que comenzó en Wuhan

He estado revisando la evidencia de la propagación temprana del virus en 2019 y los primeros casos confirmados y he llegado a lo que creo que es el curso más probable de cómo surgió el virus.

Para abreviar una historia larga (más o menos), parece que el virus se estaba propagando a nivel mundial en la segunda quincena de noviembre de 2019. Lo que era difícil de entender era por qué, si estaba en países de todo el mundo ese invierno, el explosivo los brotes solo comenzaron en febrero y marzo de 2020.

Mirando nuevamente los informes de la aparición del virus en detalle, parece que esto se debe a que el viaje del virus desde la primera aparición en otoño de 2019 hasta los brotes explosivos a principios de 2020 ocurrió de una manera más lenta y escalonada de lo que podríamos esperar de un simple comprensión de los virus. Esto no se debe a que el virus no estuviera presente en los países antes de causar brotes explosivos allí (esa es la suposición simplista que los datos contradicen), sino a que el virus no siempre causa brotes explosivos cuando está presente.

El nuevo virus similar al SARS parece haber comenzado a infectar a los humanos a fines de octubre de 2019. Esto fue muy probable en Wuhan. Se podría sugerir que si el virus se estaba propagando a nivel mundial en noviembre de 2019, podría haber comenzado en cualquier lugar y el hecho de que se detectó por primera vez en Wuhan no implica nada sobre dónde comenzó.

Sin embargo, parece que el brote de diciembre en Wuhan, donde se detectó por primera vez, fue el más grande hasta esa fecha. Además, al mes siguiente, Wuhan fue el primer lugar en experimentar un brote explosivo que puso a prueba los servicios de salud, algunas semanas antes que en cualquier otro lugar. El hecho de que estuviera a la vanguardia en estos brotes más grandes es un fuerte indicador de que el virus había estado allí por más tiempo y que originalmente surgió allí.

Molecular reloj estudios, que analizan la composición genética de los primeros casos para calcular cuándo existió su ancestro común más reciente, tienden a situar la aparición del virus a fines de octubre o principios de noviembre, lo que es consistente con la propagación global hacia fines de noviembre. 

En China, un informe del gobierno filtrado sobre casos tempranos en Wuhan identificó a nueve pacientes hospitalizados en noviembre de 2019 con lo que luego se confirmó como COVID-19 (la fecha de aparición más temprana de los síntomas fue el 17 de noviembre), aunque estos nunca se agregaron al total oficial. A estudio  también afirmó no encontrar anticuerpos neutralizantes en los donantes de sangre de Wuhan entre septiembre y diciembre de 2019, aunque no está claro qué tan confiable es esto.

En Brasil, muestras de aguas residuales almacenadas dio positivo a partir del 27 de noviembre de 2019, lo que indica una importante propagación comunitaria del SARS-CoV-2 a finales de mes. Curiosamente, muestras de italia en un estudio separado no dio positivo hasta el 18 de diciembre. No han aparecido resultados positivos de aguas residuales antes de esto en ninguna parte (a excepción de un positivo anómalo para Barcelona en marzo de 2019 que se cree ampliamente que es un falsos positivos).

En Inglaterra, Estudio REACT de Imperial evaluó alrededor de 150,000 personas en busca de anticuerpos a principios de 2021 y preguntó a los que dieron positivo cuándo recordaban haber tenido síntomas. Esto resultó en el siguiente gráfico. 

Se puede ver un aumento notable en la enfermedad sintomática desde finales de noviembre de 2019 a un nivel constante que continúa durante el invierno. El estallido explosivo de la primera ola a fines de febrero de 2020 también es claramente visible. Este gráfico ilustra claramente cómo el virus puede circular durante meses a un nivel bajo (tres meses en este caso), incluso durante la temporada de gripe invernal, antes de que ocurra un brote explosivo, aparentemente inesperado.

No tenemos buenos datos de los Estados Unidos sobre la propagación temprana, ya que el país ha fallado constantemente en realizar estudios sobre muestras almacenadas de aguas residuales o de individuos, excepto por uno. Estudio de anticuerpos de la Cruz Roja que encontró anticuerpos a mediados de diciembre de 2019, pero no analizó muestras anteriores ni confirmó con pruebas de ARN viral.

No obstante, no han faltado informes de noticias de los EE. UU. que han contado las historias de varias personas que se enfermaron con una enfermedad similar a la de Covid en noviembre de 2019 y luego dieron positivo por anticuerpos de Covid (cuando no habían estado enfermas en el ínterin) .

Estos individuos incluyen Michael Melham de Nueva Jersey, quien informa estar infectado junto con varios otros en una conferencia alrededor del 21 de noviembre de 2019; uf tukel, quien informa haber sido infectado en Florida junto con otros 10 a fines de noviembre de 2019; Stephen Taylor y su esposa, contagiados en Texas en noviembre de 2019; y Jim óxido, infectado en Nebraska el mismo mes. Bill Rice, Jr. tiene reunidos las historias de los medios de estos primeros casos de EE. UU. confirmados por anticuerpos. Llama la atención que ninguno de ellos afirma haber sido infectado antes de noviembre.

Esta evidencia de la difusión de fines de noviembre en China, Brasil, Inglaterra y Estados Unidos es, creo, muy persuasiva; incluso si uno o dos de los casos resultan estar equivocados, no creo que sea probable que todos lo estén. También son consistentes con las estimaciones de los estudios de reloj molecular antes mencionados.

Esta evidencia sugiere que el virus no se estaba propagando a nivel mundial mucho antes. Esto se basa en los aspectos negativos de los estudios de aguas residuales, los niveles insignificantes en el estudio Imperial, la falta de estadounidenses que reporten enfermedades y la ausencia de pacientes en China. Los estudios que parecen mostrar una propagación mundial más temprana pueden deberse a una reacción cruzada de anticuerpos oa la contaminación de las pruebas de PCR de gran aumento.

Esto nos permite concluir que el virus se estaba propagando a un nivel bajo en todo el mundo a fines de noviembre de 2019, pero probablemente no mucho antes. ¿Qué pasó después?

El brote en el mercado de Huanan parece haber comenzado alrededor del 1 de diciembre; esta fue la primera fecha de aparición de síntomas en el primer grupo de pacientes confirmados de Covid, quien comenzó su ingreso hospitalario el 16 de diciembre. Este brote parece haber sido significativamente más grande que otros brotes hasta ese momento. Hasta el 2 de enero, 41 pacientes habían sido confirmado como ingresado en el hospital con una prueba de Covid positiva junto con neumonía y una tomografía computarizada de tórax característica; seis de ellos murieron más tarde.

Fue este grupo de hospitalizaciones lo que condujo a la detección del virus, como al menos nueve muestras de estos pacientes fueron enviados por médicos para un análisis genómico entre el 24 y el 31 de diciembre de 2019. Por lo tanto, la detección del virus en el brote del mercado húmedo parece haber sido una consecuencia directa de la gravedad de ese brote: causó significativamente más hospitalizaciones que otros brotes hasta ese momento y provocó que varios médicos enviaran muestras para su identificación de forma independiente. Esto hizo que fuera básicamente inevitable que se detectara durante este brote.

Dicho esto, el brote fue muy pequeño en comparación con la mayoría de las olas que hemos visto desde 2020 y, de hecho, en comparación con lo que sucedió en China el mes siguiente. Observar la curva de muertes por covid informadas en China en 2020 indica que el brote explosivo en la región realmente no comenzó hasta los primeros días de enero (contando hacia atrás unos 20 días).

Esto puede explicar por qué hubo una inicial incertidumbre sobre si hubo transmisión de persona a persona, mientras que el 14 de enero se hizo cada vez más evidente que estaban en medio de una oleada explosiva por primera vez. También fue probable que el reconocimiento de este brote explosivo llevara a las autoridades chinas a imponer restricciones a Wuhan a partir del 23 de enero.

Curiosamente, el brote explosivo de enero en la provincia de Hubei no se repitió en otras partes de China, que en gran parte no se vieron afectadas por el virus en este momento. En cambio, el siguiente lugar para ver un brote explosivo fue Corea del Sur, más de un mes después, en febrero, y una vez más se limitó extrañamente en gran parte a una ciudad, Daegu. Fue en una escala similar al brote de Wuhan con un número similar de muertes.

A continuación fue el turno de Italia e Irán experimentarán brotes explosivos a partir de mediados de febrero. El brote en Italia todavía se restringió principalmente a una parte del país, aunque la escala fue más allá de lo que se había visto hasta ahora, y el brote iraní fue de un magnitud similar. Luego siguieron Nueva York y el noreste de los Estados Unidos, y también Inglaterra, Francia y gran parte de Europa Occidental (aunque no Europa del Este ni gran parte del resto de los Estados Unidos). Todos estos brotes fueron mucho más cerca a la escala italiana más grande que la escala china y surcoreana. Otros lugares continuaron con una propagación de bajo nivel hasta que tuvieron sus primeras olas explosivas más tarde en 2020, o en algunos casos en 2021 o incluso en 2022.

Lo que me sorprende de esto es cómo el tamaño y el alcance de los brotes aumentaron gradualmente entre noviembre de 2019 y febrero de 2020. La propagación en noviembre de 2019 fue global pero de bajo nivel. En diciembre, el brote del mercado húmedo de Wuhan llevó las cosas a un nivel superior, lo que resultó en un mayor número de hospitalizaciones y, por lo tanto, en la detección del virus. Luego, en enero, Wuhan experimentó el primer brote explosivo de covid y una ola de muertes. Y en febrero comenzaron las grandes olas europeas y americanas, aumentando la escala varios puntos, donde se mantuvo en gran medida. (Omicron, cuando apareció a fines de 2021, aumentó aún más el tamaño de los brotes, pero redujo considerablemente la tasa de mortalidad).

Esto proporciona, creo, una imagen precisa de cómo surgió el virus, a través de un movimiento gradual hacia brotes cada vez más grandes desde un comienzo desfavorable de propagación de bajo nivel en noviembre. Este movimiento es, presumo, resultado de cambios genéticos en el virus, que alteran su transmisibilidad en diferentes poblaciones y contextos, hipótesis que está en línea con las conclusiones de estudios de reloj molecular.

Por lo tanto, creo que podemos estar razonablemente seguros de que el virus surgió por primera vez en Wuhan durante el otoño de 2019 y no solo se detectó allí por primera vez, ya que Wuhan fue el primero en experimentar los brotes más grandes tanto en diciembre como en enero, lo que sugiere que el virus había estado allí. el mas largo.

Reimpresión de Escéptico diario